Dada la escasa disponibilidad de órganos compatibles para un transplante, y ante la disminución de la calidad de vida de los pacientes en lista de espera, puede priorizarse la realización de un transplante de un órgano sólido distinto de corazón desde un donante infectado con Trypanosoma cruzi, por sobre la espera de un órgano sano. Por este motivo, es importante realizar un seguimiento de pacientes transplantados cursando la etapa crónica de la Enfermedad de Chagas, o que recibieron un órgano de donante infectado. La técnica de PCR multiplex en tiempo real presenta la ventaja de una elevada sensibilidad y especificidad, y puede detectar reactivaciones en etapas tempranas. Sin embargo, consideramos que podría mejorarse utilizando una técnica automatizada de extracción, que a su vez eliminaría el “cuello de botella” que limita el procesamiento de grandes cantidades de muestras para la realización de ensayos clínicos. El objetivo de este trabajo es validar una técnica automatizada de extracción de ADN para diagnóstico molecular de infección por Trypanosoma cruzi, mediante la utilización de un robot comercial, que permita mejorar la sensibilidad y especificidad respecto del método manual, y validar esta metodología en el marco del seguimiento de pacientes transplantados.